Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NRXN1Q9ULB1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NRXN1Q9ULB1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
NRXN1Q9ULB1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NRXN1Q9ULB1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NRXN1Q9ULB1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NRXN1Q9ULB1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
NRXN1Q9ULB1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NRXN1Q9ULB1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NRXN1Q9ULB1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NRXN1Q9ULB1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NRXN1Q9ULB1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NRXN1Q9ULB1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NRXN1Q9ULB1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NRXN1Q9ULB1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NRXN1Q9ULB1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NRXN1Q9ULB1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
NRXN1Q9ULB1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NRXN1Q9ULB1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NRXN1Q9ULB1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NRXN1Q9ULB1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NRXN1Q9ULB1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NRXN1Q9ULB1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
NRXN1Q9ULB1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
NRXN1Q9ULB1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
NRXN1Q9ULB1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
NRXN1Q9ULB1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
NRXN1Q9ULB1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NRXN1Q9ULB1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NRXN1Q9ULB1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NRXN1Q9ULB1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NRXN1Q9ULB1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NRXN1Q9ULB1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NRXN1Q9ULB1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NRXN1Q9ULB1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NRXN1Q9ULB1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NRXN1Q9ULB1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NRXN1Q9ULB1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NRXN1Q9ULB1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NRXN1Q9ULB1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NRXN1Q9ULB1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NRXN1Q9ULB1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NRXN1Q9ULB1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
NRXN1Q9ULB1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
NRXN1Q9ULB1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NRXN1Q9ULB1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NRXN1Q9ULB1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NRXN1Q9ULB1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NRXN1Q9ULB1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NRXN1Q9ULB1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NRXN1Q9ULB1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NRXN1Q9ULB1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NRXN1Q9ULB1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NRXN1Q9ULB1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NRXN1Q9ULB1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NRXN1Q9ULB1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NRXN1Q9ULB1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
NRXN1Q9ULB1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
NRXN1Q9ULB1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NRXN1Q9ULB1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NRXN1Q9ULB1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NRXN1Q9ULB1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
NRXN1Q9ULB1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NRXN1Q9ULB1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NRXN1Q9ULB1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NRXN1Q9ULB1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NRXN1Q9ULB1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NRXN1Q9ULB1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NRXN1Q9ULB1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NRXN1Q9ULB1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NRXN1Q9ULB1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NRXN1Q9ULB1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NRXN1Q9ULB1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
NRXN1Q9ULB1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NRXN1Q9ULB1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NRXN1Q9ULB1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NRXN1Q9ULB1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NRXN1Q9ULB1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NRXN1Q9ULB1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NRXN1Q9ULB1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NRXN1Q9ULB1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NRXN1Q9ULB1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NRXN1Q9ULB1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NRXN1Q9ULB1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NRXN1Q9ULB1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NRXN1Q9ULB1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NRXN1Q9ULB1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NRXN1Q9ULB1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NRXN1Q9ULB1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NRXN1Q9ULB1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NRXN1Q9ULB1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NRXN1Q9ULB1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NRXN1Q9ULB1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NRXN1Q9ULB1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NRXN1Q9ULB1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NRXN1Q9ULB1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NRXN1Q9ULB1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NRXN1Q9ULB1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NRXN1Q9ULB1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NRXN1Q9ULB1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms