Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DSEQ9UL01 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSEQ9UL01 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSEQ9UL01 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSEQ9UL01 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DSEQ9UL01 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSEQ9UL01 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSEQ9UL01 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DSEQ9UL01 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSEQ9UL01 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DSEQ9UL01 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DSEQ9UL01 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DSEQ9UL01 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DSEQ9UL01 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
DSEQ9UL01 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DSEQ9UL01 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DSEQ9UL01 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DSEQ9UL01 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
DSEQ9UL01 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DSEQ9UL01 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DSEQ9UL01 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DSEQ9UL01 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DSEQ9UL01 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DSEQ9UL01 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DSEQ9UL01 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DSEQ9UL01 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DSEQ9UL01 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DSEQ9UL01 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DSEQ9UL01 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DSEQ9UL01 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DSEQ9UL01 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DSEQ9UL01 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DSEQ9UL01 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DSEQ9UL01 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms