Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ9

PCOLCE2, Procollagen C-endopeptidase enhancer 2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCE2Q9UKZ9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCOLCE2Q9UKZ9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PCOLCE2Q9UKZ9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCOLCE2Q9UKZ9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCOLCE2Q9UKZ9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCOLCE2Q9UKZ9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCOLCE2Q9UKZ9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCOLCE2Q9UKZ9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PCOLCE2Q9UKZ9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCOLCE2Q9UKZ9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCOLCE2Q9UKZ9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCOLCE2Q9UKZ9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCOLCE2Q9UKZ9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCOLCE2Q9UKZ9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCOLCE2Q9UKZ9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCOLCE2Q9UKZ9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCOLCE2Q9UKZ9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCOLCE2Q9UKZ9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCOLCE2Q9UKZ9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCOLCE2Q9UKZ9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCOLCE2Q9UKZ9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms