Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR5

ERG28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERG28Q9UKR5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERG28Q9UKR5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERG28Q9UKR5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms