Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CASP8AP2Q9UKL3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CASP8AP2Q9UKL3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CASP8AP2Q9UKL3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CASP8AP2Q9UKL3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CASP8AP2Q9UKL3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CASP8AP2Q9UKL3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CASP8AP2Q9UKL3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CASP8AP2Q9UKL3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CASP8AP2Q9UKL3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CASP8AP2Q9UKL3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CASP8AP2Q9UKL3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CASP8AP2Q9UKL3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CASP8AP2Q9UKL3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CASP8AP2Q9UKL3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CASP8AP2Q9UKL3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CASP8AP2Q9UKL3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CASP8AP2Q9UKL3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CASP8AP2Q9UKL3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CASP8AP2Q9UKL3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CASP8AP2Q9UKL3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CASP8AP2Q9UKL3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CASP8AP2Q9UKL3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CASP8AP2Q9UKL3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CASP8AP2Q9UKL3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CASP8AP2Q9UKL3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CASP8AP2Q9UKL3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CASP8AP2Q9UKL3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CASP8AP2Q9UKL3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CASP8AP2Q9UKL3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CASP8AP2Q9UKL3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CASP8AP2Q9UKL3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CASP8AP2Q9UKL3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CASP8AP2Q9UKL3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CASP8AP2Q9UKL3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CASP8AP2Q9UKL3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CASP8AP2Q9UKL3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CASP8AP2Q9UKL3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CASP8AP2Q9UKL3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CASP8AP2Q9UKL3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CASP8AP2Q9UKL3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CASP8AP2Q9UKL3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CASP8AP2Q9UKL3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CASP8AP2Q9UKL3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CASP8AP2Q9UKL3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CASP8AP2Q9UKL3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CASP8AP2Q9UKL3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CASP8AP2Q9UKL3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASP8AP2Q9UKL3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASP8AP2Q9UKL3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASP8AP2Q9UKL3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASP8AP2Q9UKL3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASP8AP2Q9UKL3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CASP8AP2Q9UKL3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASP8AP2Q9UKL3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASP8AP2Q9UKL3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASP8AP2Q9UKL3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASP8AP2Q9UKL3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASP8AP2Q9UKL3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASP8AP2Q9UKL3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASP8AP2Q9UKL3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASP8AP2Q9UKL3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASP8AP2Q9UKL3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASP8AP2Q9UKL3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASP8AP2Q9UKL3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASP8AP2Q9UKL3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASP8AP2Q9UKL3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASP8AP2Q9UKL3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CASP8AP2Q9UKL3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASP8AP2Q9UKL3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASP8AP2Q9UKL3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASP8AP2Q9UKL3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASP8AP2Q9UKL3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASP8AP2Q9UKL3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASP8AP2Q9UKL3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASP8AP2Q9UKL3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CASP8AP2Q9UKL3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASP8AP2Q9UKL3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASP8AP2Q9UKL3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASP8AP2Q9UKL3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CASP8AP2Q9UKL3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CASP8AP2Q9UKL3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CASP8AP2Q9UKL3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CASP8AP2Q9UKL3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CASP8AP2Q9UKL3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CASP8AP2Q9UKL3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CASP8AP2Q9UKL3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CASP8AP2Q9UKL3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASP8AP2Q9UKL3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CASP8AP2Q9UKL3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CASP8AP2Q9UKL3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CASP8AP2Q9UKL3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CASP8AP2Q9UKL3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASP8AP2Q9UKL3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASP8AP2Q9UKL3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASP8AP2Q9UKL3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms