Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL4Q9UJQ4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SALL4Q9UJQ4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms