Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLCO3A1Q9UIG8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms