Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHY1

NRBP1, Nuclear receptor-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRBP1Q9UHY1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NRBP1Q9UHY1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NRBP1Q9UHY1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NRBP1Q9UHY1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NRBP1Q9UHY1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NRBP1Q9UHY1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NRBP1Q9UHY1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NRBP1Q9UHY1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NRBP1Q9UHY1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NRBP1Q9UHY1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NRBP1Q9UHY1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NRBP1Q9UHY1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NRBP1Q9UHY1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NRBP1Q9UHY1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NRBP1Q9UHY1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NRBP1Q9UHY1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NRBP1Q9UHY1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NRBP1Q9UHY1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NRBP1Q9UHY1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NRBP1Q9UHY1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NRBP1Q9UHY1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NRBP1Q9UHY1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NRBP1Q9UHY1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NRBP1Q9UHY1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NRBP1Q9UHY1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NRBP1Q9UHY1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NRBP1Q9UHY1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NRBP1Q9UHY1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NRBP1Q9UHY1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NRBP1Q9UHY1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NRBP1Q9UHY1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NRBP1Q9UHY1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NRBP1Q9UHY1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NRBP1Q9UHY1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NRBP1Q9UHY1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NRBP1Q9UHY1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NRBP1Q9UHY1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NRBP1Q9UHY1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NRBP1Q9UHY1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NRBP1Q9UHY1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.6 ms