Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PUF60Q9UHX1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PUF60Q9UHX1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PUF60Q9UHX1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PUF60Q9UHX1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PUF60Q9UHX1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PUF60Q9UHX1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PUF60Q9UHX1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PUF60Q9UHX1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PUF60Q9UHX1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PUF60Q9UHX1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PUF60Q9UHX1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PUF60Q9UHX1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PUF60Q9UHX1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PUF60Q9UHX1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PUF60Q9UHX1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PUF60Q9UHX1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PUF60Q9UHX1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PUF60Q9UHX1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PUF60Q9UHX1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PUF60Q9UHX1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PUF60Q9UHX1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PUF60Q9UHX1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PUF60Q9UHX1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PUF60Q9UHX1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PUF60Q9UHX1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PUF60Q9UHX1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PUF60Q9UHX1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PUF60Q9UHX1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PUF60Q9UHX1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PUF60Q9UHX1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PUF60Q9UHX1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PUF60Q9UHX1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PUF60Q9UHX1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PUF60Q9UHX1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms