Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGC7

MTRF1L, Peptide chain release factor 1-like, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRF1LQ9UGC7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTRF1LQ9UGC7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTRF1LQ9UGC7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms