Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms