Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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COPS7AQ9UBW8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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COPS7AQ9UBW8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COPS7AQ9UBW8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPS7AQ9UBW8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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