Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
DKK3Q9UBP4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms