Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHD7Q9P2D1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHD7Q9P2D1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms