Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms