Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HMG20BQ9P0W2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HMG20BQ9P0W2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HMG20BQ9P0W2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HMG20BQ9P0W2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HMG20BQ9P0W2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HMG20BQ9P0W2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HMG20BQ9P0W2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HMG20BQ9P0W2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HMG20BQ9P0W2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HMG20BQ9P0W2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HMG20BQ9P0W2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HMG20BQ9P0W2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HMG20BQ9P0W2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
HMG20BQ9P0W2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HMG20BQ9P0W2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HMG20BQ9P0W2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HMG20BQ9P0W2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HMG20BQ9P0W2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.57■■■□□ 2
HMG20BQ9P0W2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HMG20BQ9P0W2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HMG20BQ9P0W2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HMG20BQ9P0W2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HMG20BQ9P0W2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HMG20BQ9P0W2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.56■■■□□ 2
HMG20BQ9P0W2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.56■■■□□ 2
HMG20BQ9P0W2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HMG20BQ9P0W2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HMG20BQ9P0W2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HMG20BQ9P0W2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HMG20BQ9P0W2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HMG20BQ9P0W2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HMG20BQ9P0W2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
HMG20BQ9P0W2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HMG20BQ9P0W2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
HMG20BQ9P0W2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HMG20BQ9P0W2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.55■■■□□ 2
HMG20BQ9P0W2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HMG20BQ9P0W2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HMG20BQ9P0W2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HMG20BQ9P0W2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HMG20BQ9P0W2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HMG20BQ9P0W2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HMG20BQ9P0W2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HMG20BQ9P0W2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HMG20BQ9P0W2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.54■■■□□ 2
HMG20BQ9P0W2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HMG20BQ9P0W2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HMG20BQ9P0W2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HMG20BQ9P0W2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HMG20BQ9P0W2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
HMG20BQ9P0W2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HMG20BQ9P0W2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HMG20BQ9P0W2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HMG20BQ9P0W2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.53■■■□□ 2
HMG20BQ9P0W2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
HMG20BQ9P0W2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HMG20BQ9P0W2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HMG20BQ9P0W2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HMG20BQ9P0W2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HMG20BQ9P0W2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HMG20BQ9P0W2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HMG20BQ9P0W2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HMG20BQ9P0W2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HMG20BQ9P0W2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HMG20BQ9P0W2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
HMG20BQ9P0W2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
HMG20BQ9P0W2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
HMG20BQ9P0W2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms