Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MTMR4Q9NYA4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MTMR4Q9NYA4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MTMR4Q9NYA4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MTMR4Q9NYA4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
MTMR4Q9NYA4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
MTMR4Q9NYA4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
MTMR4Q9NYA4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MTMR4Q9NYA4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
MTMR4Q9NYA4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MTMR4Q9NYA4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MTMR4Q9NYA4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MTMR4Q9NYA4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
MTMR4Q9NYA4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MTMR4Q9NYA4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MTMR4Q9NYA4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MTMR4Q9NYA4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MTMR4Q9NYA4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MTMR4Q9NYA4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
MTMR4Q9NYA4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
MTMR4Q9NYA4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MTMR4Q9NYA4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MTMR4Q9NYA4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MTMR4Q9NYA4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MTMR4Q9NYA4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MTMR4Q9NYA4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MTMR4Q9NYA4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
MTMR4Q9NYA4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MTMR4Q9NYA4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MTMR4Q9NYA4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MTMR4Q9NYA4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MTMR4Q9NYA4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MTMR4Q9NYA4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MTMR4Q9NYA4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MTMR4Q9NYA4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MTMR4Q9NYA4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
MTMR4Q9NYA4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MTMR4Q9NYA4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MTMR4Q9NYA4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
MTMR4Q9NYA4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
MTMR4Q9NYA4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MTMR4Q9NYA4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms