Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA1

SPHK1, Sphingosine kinase 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1Q9NYA1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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