Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY91

SLC5A4, Solute carrier family 5 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A4Q9NY91 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC5A4Q9NY91 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC5A4Q9NY91 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC5A4Q9NY91 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC5A4Q9NY91 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC5A4Q9NY91 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC5A4Q9NY91 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC5A4Q9NY91 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC5A4Q9NY91 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC5A4Q9NY91 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC5A4Q9NY91 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC5A4Q9NY91 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC5A4Q9NY91 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC5A4Q9NY91 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC5A4Q9NY91 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC5A4Q9NY91 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC5A4Q9NY91 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC5A4Q9NY91 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC5A4Q9NY91 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC5A4Q9NY91 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC5A4Q9NY91 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC5A4Q9NY91 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC5A4Q9NY91 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC5A4Q9NY91 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC5A4Q9NY91 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC5A4Q9NY91 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC5A4Q9NY91 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC5A4Q9NY91 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC5A4Q9NY91 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC5A4Q9NY91 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC5A4Q9NY91 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC5A4Q9NY91 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC5A4Q9NY91 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC5A4Q9NY91 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC5A4Q9NY91 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC5A4Q9NY91 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC5A4Q9NY91 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC5A4Q9NY91 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC5A4Q9NY91 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC5A4Q9NY91 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC5A4Q9NY91 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC5A4Q9NY91 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC5A4Q9NY91 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC5A4Q9NY91 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms