Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms