Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY27

PPP4R2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R2Q9NY27 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PPP4R2Q9NY27 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PPP4R2Q9NY27 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PPP4R2Q9NY27 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PPP4R2Q9NY27 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PPP4R2Q9NY27 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PPP4R2Q9NY27 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PPP4R2Q9NY27 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPP4R2Q9NY27 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PPP4R2Q9NY27 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPP4R2Q9NY27 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPP4R2Q9NY27 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPP4R2Q9NY27 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPP4R2Q9NY27 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPP4R2Q9NY27 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPP4R2Q9NY27 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPP4R2Q9NY27 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPP4R2Q9NY27 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPP4R2Q9NY27 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPP4R2Q9NY27 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPP4R2Q9NY27 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPP4R2Q9NY27 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPP4R2Q9NY27 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPP4R2Q9NY27 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPP4R2Q9NY27 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPP4R2Q9NY27 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPP4R2Q9NY27 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPP4R2Q9NY27 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPP4R2Q9NY27 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPP4R2Q9NY27 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPP4R2Q9NY27 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPP4R2Q9NY27 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PPP4R2Q9NY27 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PPP4R2Q9NY27 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PPP4R2Q9NY27 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PPP4R2Q9NY27 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms