Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOR4AQ9NXH8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms