Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CWC25Q9NXE8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CWC25Q9NXE8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CWC25Q9NXE8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CWC25Q9NXE8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CWC25Q9NXE8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CWC25Q9NXE8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CWC25Q9NXE8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CWC25Q9NXE8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CWC25Q9NXE8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CWC25Q9NXE8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CWC25Q9NXE8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CWC25Q9NXE8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CWC25Q9NXE8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CWC25Q9NXE8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CWC25Q9NXE8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CWC25Q9NXE8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CWC25Q9NXE8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CWC25Q9NXE8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CWC25Q9NXE8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CWC25Q9NXE8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CWC25Q9NXE8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CWC25Q9NXE8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CWC25Q9NXE8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CWC25Q9NXE8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CWC25Q9NXE8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CWC25Q9NXE8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CWC25Q9NXE8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CWC25Q9NXE8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CWC25Q9NXE8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CWC25Q9NXE8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CWC25Q9NXE8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CWC25Q9NXE8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CWC25Q9NXE8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CWC25Q9NXE8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CWC25Q9NXE8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CWC25Q9NXE8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CWC25Q9NXE8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CWC25Q9NXE8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CWC25Q9NXE8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CWC25Q9NXE8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CWC25Q9NXE8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CWC25Q9NXE8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CWC25Q9NXE8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CWC25Q9NXE8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CWC25Q9NXE8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CWC25Q9NXE8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CWC25Q9NXE8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CWC25Q9NXE8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CWC25Q9NXE8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CWC25Q9NXE8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CWC25Q9NXE8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CWC25Q9NXE8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CWC25Q9NXE8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 209.6 ms