Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXB0

MKS1, Meckel syndrome type 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1Q9NXB0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKS1Q9NXB0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms