Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK13-1Q9NX77 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.3 ms