Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CMTM6Q9NX76 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMTM6Q9NX76 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms