Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX58

LYAR, Cell growth-regulating nucleolar protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYARQ9NX58 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
LYARQ9NX58 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LYARQ9NX58 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LYARQ9NX58 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LYARQ9NX58 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LYARQ9NX58 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LYARQ9NX58 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LYARQ9NX58 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LYARQ9NX58 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LYARQ9NX58 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LYARQ9NX58 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LYARQ9NX58 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LYARQ9NX58 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LYARQ9NX58 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LYARQ9NX58 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LYARQ9NX58 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LYARQ9NX58 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LYARQ9NX58 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms