Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX57

RAB20, Ras-related protein Rab-20, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20Q9NX57 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB20Q9NX57 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB20Q9NX57 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB20Q9NX57 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB20Q9NX57 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB20Q9NX57 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB20Q9NX57 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB20Q9NX57 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB20Q9NX57 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB20Q9NX57 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB20Q9NX57 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB20Q9NX57 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB20Q9NX57 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB20Q9NX57 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB20Q9NX57 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms