Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
COMMD8Q9NX08 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COMMD8Q9NX08 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
COMMD8Q9NX08 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
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