Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW68

BSDC1, BSD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSDC1Q9NW68 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BSDC1Q9NW68 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
BSDC1Q9NW68 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
BSDC1Q9NW68 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BSDC1Q9NW68 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BSDC1Q9NW68 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BSDC1Q9NW68 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BSDC1Q9NW68 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BSDC1Q9NW68 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BSDC1Q9NW68 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BSDC1Q9NW68 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BSDC1Q9NW68 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BSDC1Q9NW68 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
BSDC1Q9NW68 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BSDC1Q9NW68 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BSDC1Q9NW68 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BSDC1Q9NW68 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BSDC1Q9NW68 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BSDC1Q9NW68 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BSDC1Q9NW68 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
BSDC1Q9NW68 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BSDC1Q9NW68 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BSDC1Q9NW68 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BSDC1Q9NW68 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BSDC1Q9NW68 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BSDC1Q9NW68 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BSDC1Q9NW68 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BSDC1Q9NW68 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BSDC1Q9NW68 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BSDC1Q9NW68 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
BSDC1Q9NW68 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BSDC1Q9NW68 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BSDC1Q9NW68 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BSDC1Q9NW68 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BSDC1Q9NW68 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BSDC1Q9NW68 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BSDC1Q9NW68 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BSDC1Q9NW68 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BSDC1Q9NW68 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BSDC1Q9NW68 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
BSDC1Q9NW68 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BSDC1Q9NW68 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BSDC1Q9NW68 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BSDC1Q9NW68 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BSDC1Q9NW68 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BSDC1Q9NW68 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms