Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
FBXO28Q9NVF7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FBXO28Q9NVF7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FBXO28Q9NVF7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FBXO28Q9NVF7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FBXO28Q9NVF7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FBXO28Q9NVF7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FBXO28Q9NVF7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FBXO28Q9NVF7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
FBXO28Q9NVF7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FBXO28Q9NVF7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
FBXO28Q9NVF7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FBXO28Q9NVF7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FBXO28Q9NVF7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FBXO28Q9NVF7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FBXO28Q9NVF7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FBXO28Q9NVF7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FBXO28Q9NVF7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FBXO28Q9NVF7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FBXO28Q9NVF7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FBXO28Q9NVF7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FBXO28Q9NVF7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FBXO28Q9NVF7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FBXO28Q9NVF7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FBXO28Q9NVF7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FBXO28Q9NVF7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FBXO28Q9NVF7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FBXO28Q9NVF7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FBXO28Q9NVF7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FBXO28Q9NVF7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FBXO28Q9NVF7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FBXO28Q9NVF7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
FBXO28Q9NVF7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FBXO28Q9NVF7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
FBXO28Q9NVF7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
FBXO28Q9NVF7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
FBXO28Q9NVF7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FBXO28Q9NVF7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXO28Q9NVF7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXO28Q9NVF7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXO28Q9NVF7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXO28Q9NVF7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXO28Q9NVF7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXO28Q9NVF7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXO28Q9NVF7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FBXO28Q9NVF7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FBXO28Q9NVF7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FBXO28Q9NVF7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FBXO28Q9NVF7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FBXO28Q9NVF7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FBXO28Q9NVF7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FBXO28Q9NVF7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FBXO28Q9NVF7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FBXO28Q9NVF7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FBXO28Q9NVF7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FBXO28Q9NVF7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FBXO28Q9NVF7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FBXO28Q9NVF7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FBXO28Q9NVF7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FBXO28Q9NVF7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FBXO28Q9NVF7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FBXO28Q9NVF7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FBXO28Q9NVF7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FBXO28Q9NVF7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FBXO28Q9NVF7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FBXO28Q9NVF7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FBXO28Q9NVF7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FBXO28Q9NVF7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FBXO28Q9NVF7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FBXO28Q9NVF7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FBXO28Q9NVF7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FBXO28Q9NVF7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
FBXO28Q9NVF7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FBXO28Q9NVF7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FBXO28Q9NVF7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FBXO28Q9NVF7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXO28Q9NVF7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXO28Q9NVF7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXO28Q9NVF7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXO28Q9NVF7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXO28Q9NVF7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXO28Q9NVF7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FBXO28Q9NVF7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FBXO28Q9NVF7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FBXO28Q9NVF7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FBXO28Q9NVF7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FBXO28Q9NVF7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FBXO28Q9NVF7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FBXO28Q9NVF7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FBXO28Q9NVF7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FBXO28Q9NVF7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FBXO28Q9NVF7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FBXO28Q9NVF7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FBXO28Q9NVF7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FBXO28Q9NVF7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FBXO28Q9NVF7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FBXO28Q9NVF7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FBXO28Q9NVF7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FBXO28Q9NVF7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FBXO28Q9NVF7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms