Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV31

IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP3Q9NV31 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IMP3Q9NV31 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IMP3Q9NV31 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IMP3Q9NV31 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IMP3Q9NV31 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IMP3Q9NV31 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IMP3Q9NV31 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IMP3Q9NV31 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IMP3Q9NV31 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IMP3Q9NV31 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IMP3Q9NV31 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IMP3Q9NV31 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IMP3Q9NV31 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IMP3Q9NV31 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IMP3Q9NV31 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IMP3Q9NV31 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IMP3Q9NV31 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IMP3Q9NV31 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IMP3Q9NV31 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IMP3Q9NV31 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IMP3Q9NV31 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IMP3Q9NV31 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IMP3Q9NV31 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IMP3Q9NV31 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IMP3Q9NV31 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IMP3Q9NV31 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IMP3Q9NV31 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IMP3Q9NV31 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IMP3Q9NV31 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IMP3Q9NV31 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IMP3Q9NV31 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IMP3Q9NV31 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IMP3Q9NV31 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IMP3Q9NV31 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IMP3Q9NV31 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IMP3Q9NV31 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IMP3Q9NV31 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IMP3Q9NV31 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IMP3Q9NV31 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IMP3Q9NV31 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IMP3Q9NV31 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IMP3Q9NV31 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IMP3Q9NV31 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IMP3Q9NV31 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IMP3Q9NV31 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms