Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM140Q9NV12 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms