Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GINM1Q9NU53 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GINM1Q9NU53 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GINM1Q9NU53 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GINM1Q9NU53 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GINM1Q9NU53 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GINM1Q9NU53 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GINM1Q9NU53 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GINM1Q9NU53 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GINM1Q9NU53 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GINM1Q9NU53 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GINM1Q9NU53 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GINM1Q9NU53 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GINM1Q9NU53 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GINM1Q9NU53 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GINM1Q9NU53 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GINM1Q9NU53 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GINM1Q9NU53 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GINM1Q9NU53 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GINM1Q9NU53 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GINM1Q9NU53 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GINM1Q9NU53 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
GINM1Q9NU53 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GINM1Q9NU53 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GINM1Q9NU53 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GINM1Q9NU53 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GINM1Q9NU53 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GINM1Q9NU53 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GINM1Q9NU53 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GINM1Q9NU53 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GINM1Q9NU53 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GINM1Q9NU53 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GINM1Q9NU53 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GINM1Q9NU53 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GINM1Q9NU53 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GINM1Q9NU53 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GINM1Q9NU53 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GINM1Q9NU53 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GINM1Q9NU53 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GINM1Q9NU53 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GINM1Q9NU53 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GINM1Q9NU53 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GINM1Q9NU53 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GINM1Q9NU53 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GINM1Q9NU53 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GINM1Q9NU53 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GINM1Q9NU53 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GINM1Q9NU53 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GINM1Q9NU53 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GINM1Q9NU53 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GINM1Q9NU53 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GINM1Q9NU53 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GINM1Q9NU53 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GINM1Q9NU53 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GINM1Q9NU53 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GINM1Q9NU53 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GINM1Q9NU53 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GINM1Q9NU53 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GINM1Q9NU53 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GINM1Q9NU53 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GINM1Q9NU53 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GINM1Q9NU53 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GINM1Q9NU53 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GINM1Q9NU53 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GINM1Q9NU53 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GINM1Q9NU53 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GINM1Q9NU53 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GINM1Q9NU53 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GINM1Q9NU53 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GINM1Q9NU53 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GINM1Q9NU53 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GINM1Q9NU53 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GINM1Q9NU53 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GINM1Q9NU53 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GINM1Q9NU53 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GINM1Q9NU53 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GINM1Q9NU53 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GINM1Q9NU53 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GINM1Q9NU53 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GINM1Q9NU53 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GINM1Q9NU53 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GINM1Q9NU53 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GINM1Q9NU53 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GINM1Q9NU53 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GINM1Q9NU53 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GINM1Q9NU53 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GINM1Q9NU53 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
GINM1Q9NU53 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GINM1Q9NU53 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GINM1Q9NU53 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GINM1Q9NU53 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GINM1Q9NU53 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GINM1Q9NU53 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GINM1Q9NU53 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GINM1Q9NU53 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GINM1Q9NU53 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GINM1Q9NU53 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GINM1Q9NU53 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GINM1Q9NU53 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GINM1Q9NU53 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms