Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCND1Q9NSA2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms