Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LTBP3Q9NS15 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LTBP3Q9NS15 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LTBP3Q9NS15 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LTBP3Q9NS15 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LTBP3Q9NS15 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LTBP3Q9NS15 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LTBP3Q9NS15 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LTBP3Q9NS15 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LTBP3Q9NS15 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LTBP3Q9NS15 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LTBP3Q9NS15 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LTBP3Q9NS15 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LTBP3Q9NS15 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LTBP3Q9NS15 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LTBP3Q9NS15 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LTBP3Q9NS15 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LTBP3Q9NS15 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LTBP3Q9NS15 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LTBP3Q9NS15 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
LTBP3Q9NS15 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
LTBP3Q9NS15 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LTBP3Q9NS15 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LTBP3Q9NS15 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LTBP3Q9NS15 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms