Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR1

CYTL1, Cytokine-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTL1Q9NRR1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYTL1Q9NRR1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYTL1Q9NRR1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYTL1Q9NRR1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYTL1Q9NRR1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYTL1Q9NRR1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYTL1Q9NRR1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYTL1Q9NRR1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYTL1Q9NRR1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYTL1Q9NRR1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYTL1Q9NRR1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYTL1Q9NRR1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYTL1Q9NRR1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYTL1Q9NRR1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYTL1Q9NRR1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYTL1Q9NRR1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYTL1Q9NRR1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYTL1Q9NRR1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYTL1Q9NRR1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYTL1Q9NRR1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYTL1Q9NRR1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYTL1Q9NRR1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYTL1Q9NRR1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYTL1Q9NRR1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYTL1Q9NRR1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYTL1Q9NRR1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYTL1Q9NRR1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYTL1Q9NRR1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYTL1Q9NRR1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYTL1Q9NRR1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYTL1Q9NRR1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYTL1Q9NRR1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYTL1Q9NRR1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYTL1Q9NRR1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYTL1Q9NRR1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYTL1Q9NRR1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYTL1Q9NRR1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYTL1Q9NRR1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYTL1Q9NRR1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYTL1Q9NRR1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CYTL1Q9NRR1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYTL1Q9NRR1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYTL1Q9NRR1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYTL1Q9NRR1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYTL1Q9NRR1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CYTL1Q9NRR1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms