Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
C8orf4Q9NR00 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms