Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LHX9Q9NQ69 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms