Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG4

PCDH12, Protocadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH12Q9NPG4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDH12Q9NPG4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDH12Q9NPG4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDH12Q9NPG4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDH12Q9NPG4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDH12Q9NPG4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDH12Q9NPG4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDH12Q9NPG4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDH12Q9NPG4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDH12Q9NPG4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDH12Q9NPG4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDH12Q9NPG4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDH12Q9NPG4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDH12Q9NPG4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDH12Q9NPG4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDH12Q9NPG4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCDH12Q9NPG4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCDH12Q9NPG4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDH12Q9NPG4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms