Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms