Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBI1

PARVB, Beta-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVBQ9HBI1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARVBQ9HBI1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms