Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB31

SEBOX, Homeobox protein SEBOX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEBOXQ9HB31 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEBOXQ9HB31 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SEBOXQ9HB31 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SEBOXQ9HB31 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SEBOXQ9HB31 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEBOXQ9HB31 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEBOXQ9HB31 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEBOXQ9HB31 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEBOXQ9HB31 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEBOXQ9HB31 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEBOXQ9HB31 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SEBOXQ9HB31 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEBOXQ9HB31 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEBOXQ9HB31 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SEBOXQ9HB31 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEBOXQ9HB31 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEBOXQ9HB31 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEBOXQ9HB31 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SEBOXQ9HB31 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEBOXQ9HB31 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SEBOXQ9HB31 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEBOXQ9HB31 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEBOXQ9HB31 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEBOXQ9HB31 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
SEBOXQ9HB31 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SEBOXQ9HB31 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SEBOXQ9HB31 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEBOXQ9HB31 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SEBOXQ9HB31 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms