Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC52A2Q9HAB3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC52A2Q9HAB3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC52A2Q9HAB3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC52A2Q9HAB3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC52A2Q9HAB3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC52A2Q9HAB3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC52A2Q9HAB3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC52A2Q9HAB3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC52A2Q9HAB3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC52A2Q9HAB3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC52A2Q9HAB3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC52A2Q9HAB3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC52A2Q9HAB3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC52A2Q9HAB3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC52A2Q9HAB3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC52A2Q9HAB3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC52A2Q9HAB3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC52A2Q9HAB3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC52A2Q9HAB3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC52A2Q9HAB3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
SLC52A2Q9HAB3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SLC52A2Q9HAB3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC52A2Q9HAB3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC52A2Q9HAB3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC52A2Q9HAB3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC52A2Q9HAB3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC52A2Q9HAB3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC52A2Q9HAB3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC52A2Q9HAB3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC52A2Q9HAB3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC52A2Q9HAB3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC52A2Q9HAB3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC52A2Q9HAB3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC52A2Q9HAB3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC52A2Q9HAB3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC52A2Q9HAB3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC52A2Q9HAB3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC52A2Q9HAB3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC52A2Q9HAB3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC52A2Q9HAB3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC52A2Q9HAB3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC52A2Q9HAB3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC52A2Q9HAB3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC52A2Q9HAB3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC52A2Q9HAB3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC52A2Q9HAB3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC52A2Q9HAB3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC52A2Q9HAB3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC52A2Q9HAB3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC52A2Q9HAB3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC52A2Q9HAB3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC52A2Q9HAB3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC52A2Q9HAB3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC52A2Q9HAB3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC52A2Q9HAB3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC52A2Q9HAB3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC52A2Q9HAB3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC52A2Q9HAB3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC52A2Q9HAB3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC52A2Q9HAB3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC52A2Q9HAB3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC52A2Q9HAB3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC52A2Q9HAB3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC52A2Q9HAB3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC52A2Q9HAB3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC52A2Q9HAB3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC52A2Q9HAB3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC52A2Q9HAB3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC52A2Q9HAB3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC52A2Q9HAB3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC52A2Q9HAB3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC52A2Q9HAB3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC52A2Q9HAB3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC52A2Q9HAB3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC52A2Q9HAB3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC52A2Q9HAB3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC52A2Q9HAB3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC52A2Q9HAB3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC52A2Q9HAB3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC52A2Q9HAB3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC52A2Q9HAB3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC52A2Q9HAB3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC52A2Q9HAB3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC52A2Q9HAB3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC52A2Q9HAB3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC52A2Q9HAB3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC52A2Q9HAB3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC52A2Q9HAB3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC52A2Q9HAB3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC52A2Q9HAB3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC52A2Q9HAB3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC52A2Q9HAB3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC52A2Q9HAB3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC52A2Q9HAB3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC52A2Q9HAB3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC52A2Q9HAB3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC52A2Q9HAB3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC52A2Q9HAB3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
SLC52A2Q9HAB3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms