Protein–RNA interactions for Protein: Q9H799

C5orf42, Protein JBTS17, humanhuman

Predictions only

Length 3,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf42Q9H799 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C5orf42Q9H799 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C5orf42Q9H799 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C5orf42Q9H799 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C5orf42Q9H799 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C5orf42Q9H799 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C5orf42Q9H799 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C5orf42Q9H799 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C5orf42Q9H799 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C5orf42Q9H799 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C5orf42Q9H799 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C5orf42Q9H799 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
C5orf42Q9H799 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C5orf42Q9H799 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C5orf42Q9H799 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C5orf42Q9H799 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C5orf42Q9H799 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C5orf42Q9H799 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
C5orf42Q9H799 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C5orf42Q9H799 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C5orf42Q9H799 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C5orf42Q9H799 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C5orf42Q9H799 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C5orf42Q9H799 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C5orf42Q9H799 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C5orf42Q9H799 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C5orf42Q9H799 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C5orf42Q9H799 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C5orf42Q9H799 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C5orf42Q9H799 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C5orf42Q9H799 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C5orf42Q9H799 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C5orf42Q9H799 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C5orf42Q9H799 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C5orf42Q9H799 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
C5orf42Q9H799 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C5orf42Q9H799 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C5orf42Q9H799 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C5orf42Q9H799 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C5orf42Q9H799 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C5orf42Q9H799 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C5orf42Q9H799 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C5orf42Q9H799 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
C5orf42Q9H799 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C5orf42Q9H799 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C5orf42Q9H799 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C5orf42Q9H799 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C5orf42Q9H799 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C5orf42Q9H799 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C5orf42Q9H799 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
C5orf42Q9H799 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms