Protein–RNA interactions for Protein: Q9H668

STN1, CST complex subunit STN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STN1Q9H668 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STN1Q9H668 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
STN1Q9H668 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
STN1Q9H668 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
STN1Q9H668 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
STN1Q9H668 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STN1Q9H668 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
STN1Q9H668 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STN1Q9H668 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STN1Q9H668 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STN1Q9H668 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STN1Q9H668 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STN1Q9H668 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STN1Q9H668 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STN1Q9H668 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STN1Q9H668 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STN1Q9H668 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STN1Q9H668 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STN1Q9H668 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STN1Q9H668 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STN1Q9H668 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STN1Q9H668 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STN1Q9H668 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STN1Q9H668 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STN1Q9H668 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STN1Q9H668 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STN1Q9H668 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STN1Q9H668 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STN1Q9H668 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STN1Q9H668 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STN1Q9H668 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STN1Q9H668 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STN1Q9H668 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STN1Q9H668 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STN1Q9H668 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STN1Q9H668 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STN1Q9H668 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STN1Q9H668 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STN1Q9H668 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STN1Q9H668 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
STN1Q9H668 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STN1Q9H668 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STN1Q9H668 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STN1Q9H668 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms