Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TAF1DQ9H5J8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TAF1DQ9H5J8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TAF1DQ9H5J8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TAF1DQ9H5J8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TAF1DQ9H5J8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TAF1DQ9H5J8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TAF1DQ9H5J8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TAF1DQ9H5J8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TAF1DQ9H5J8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TAF1DQ9H5J8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TAF1DQ9H5J8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TAF1DQ9H5J8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TAF1DQ9H5J8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TAF1DQ9H5J8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TAF1DQ9H5J8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TAF1DQ9H5J8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TAF1DQ9H5J8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TAF1DQ9H5J8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TAF1DQ9H5J8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TAF1DQ9H5J8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TAF1DQ9H5J8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TAF1DQ9H5J8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TAF1DQ9H5J8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TAF1DQ9H5J8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TAF1DQ9H5J8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TAF1DQ9H5J8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TAF1DQ9H5J8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TAF1DQ9H5J8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TAF1DQ9H5J8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TAF1DQ9H5J8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TAF1DQ9H5J8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TAF1DQ9H5J8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TAF1DQ9H5J8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TAF1DQ9H5J8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TAF1DQ9H5J8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TAF1DQ9H5J8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TAF1DQ9H5J8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TAF1DQ9H5J8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TAF1DQ9H5J8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TAF1DQ9H5J8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TAF1DQ9H5J8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TAF1DQ9H5J8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TAF1DQ9H5J8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms