Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDM12Q9H4Q4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRDM12Q9H4Q4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRDM12Q9H4Q4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRDM12Q9H4Q4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRDM12Q9H4Q4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRDM12Q9H4Q4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PRDM12Q9H4Q4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PRDM12Q9H4Q4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRDM12Q9H4Q4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PRDM12Q9H4Q4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PRDM12Q9H4Q4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRDM12Q9H4Q4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM12Q9H4Q4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM12Q9H4Q4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM12Q9H4Q4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM12Q9H4Q4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM12Q9H4Q4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM12Q9H4Q4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM12Q9H4Q4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM12Q9H4Q4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM12Q9H4Q4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM12Q9H4Q4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM12Q9H4Q4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM12Q9H4Q4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM12Q9H4Q4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms