Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3W5

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3Q9H3W5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRN3Q9H3W5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRN3Q9H3W5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms