Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3S1

SEMA4A, Semaphorin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4AQ9H3S1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA4AQ9H3S1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA4AQ9H3S1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA4AQ9H3S1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA4AQ9H3S1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA4AQ9H3S1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA4AQ9H3S1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA4AQ9H3S1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA4AQ9H3S1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA4AQ9H3S1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA4AQ9H3S1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA4AQ9H3S1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA4AQ9H3S1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA4AQ9H3S1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA4AQ9H3S1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA4AQ9H3S1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA4AQ9H3S1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA4AQ9H3S1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA4AQ9H3S1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA4AQ9H3S1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA4AQ9H3S1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA4AQ9H3S1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA4AQ9H3S1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA4AQ9H3S1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA4AQ9H3S1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA4AQ9H3S1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA4AQ9H3S1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA4AQ9H3S1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA4AQ9H3S1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA4AQ9H3S1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA4AQ9H3S1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA4AQ9H3S1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEMA4AQ9H3S1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEMA4AQ9H3S1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA4AQ9H3S1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms